近年来,土地综合整治项目逐年增多,但是土地综合整治项目和资金的管理与使用尚没有系统、成功的方法和经验，在具体执行过程中存在项目设计、项目建设、完工情况不实，资金截留、挪用等问题，因此如何管理好土地综合整治项目，用好土地综合整治资金，成为各级相关部门关注的问题。

目前，土地综合整治项目资金管理和使用主要存在以下几个方面的问题：一是盲目立项。很多土地综合整治项目立项前缺乏详细、科学的论证。二是项目组织、实施存在很大随意性，招投标不规范的问题很普遍，项目的组织施工分包、转包现象严重。另外，在具体工程施工、进度、材料购销以及人工费的发放等环节与资金的拨付报销脱节，财务人员难以了解工程实际用款情况，项目资金真正使用效果缺乏监管。同时，挪用项目资金，改变资金用途的情况也时有发生。三是重复建设，存在多项目重复、合并检查验收现象。

审计认为，要管好土地综合整治项目，用好项目资金，首先，要严格立项审批，充分论证土地综合整治项目可行性，减少盲目性，杜绝项目边进行、边立项、边施工、边拨款现象。其次，严格执行招投标或政府采购制度，改革资金拨付方式和渠道，杜绝项目法人单位同时扮演运动员和裁判员，以及层次分包或转包现象。第三，建立土地综合整治项目联合检查验收制度，严格项目进度、质量、完工情况的检查验收。建立由审计、财政、农业、计划、监察等部门和专家组成的项目检查验收委员会，严格检查程序，认真落实验收标准，并根据验收结果和审计机关的审计报告进行最终峻工决算。